Het eerste idee om een zee aquarium op te starten ontstond in 1954. Dat leidde in 1956 tot de opening van Zee Aquarium Bergen aan Zee. De fundamenten van het tijdens WO II afgebroken Hotel Nassau vormden de basis van het nieuwe gebouw. Eind 60-er jaren werd het gebouw uitgebreid door er een restaurant bovenop te bouwen, dat de naam Neptunus kreeg.
Nog meer verbouwingen
Eind 80-er jaren werd het gebouw ingrijpend veranderd: door de bouw van appartementen in het bovenste gedeelte veranderde Restaurant Neptunus in Neptunus Appartementen. Het Zee Aquarium werd uitgebreid, de ingang verplaatst en tussen de appartementen en het Zee Aquarium werd een tussenverdieping gemaakt. Daar kwamen drie winkel-units en een restaurant.
Aan het eind van de 90-er jaren werd het Zee Aquarium uitgebreid met verschillende groot-volume bakken, bijvoorbeeld de Noordzeebak en de Piranhabak.
